Y- տիպի մոլեկուլային մաղավերը ունեն ադամանդի նման մոտ վեց վեցանկյուն կառուցվածք: Եթե բետա վանդակը օգտագործվում է որպես կառուցվածքային ստորաբաժանում, փոխարինելու ադամանդի ածխածնի ատոմային հանգույցները, եւ երկու հարակից բետա վանդակները կապված են վեցանկյուն սյունակային վանդակների հետ, որոնցից հինգ բետա վանդակ գտնվում է կենտրոնում, իսկ մնացած չորս բետա վանդակները Ձեւավորվում է Zeolite Crystal կառուցվածքը: Շարունակելով կապվել այս կառուցվածքի հետ, ստացվում է Y տիպի մոլեկուլային մաղի կառուցվածքը: Այս կառույցում β վանդակի եւ վեցանկյուն սյունակի վանդակի ձեւավորված մեծ վանդակը ութ միակողմանի զեոլիտ վանդակ է, եւ դրանց միջքաղաքային պատուհանի անցքերը տասներկու երկուական օղակներ են, որը կազմում է 0,74nm, որը Y- տիպի մոլեկուլային մաղի ծակոտկեն է: X տիպի մոլեկուլային մաղի եւ Y տիպի մոլեկուլային մաղի կառուցվածքը ճիշտ նույնն է, բայց y տիպի մոլեկուլային մաղի սիլիցիալ մետաղական հարաբերակցությունը բարձր է, ուստի ավելի լայնորեն օգտագործվում է հիդրոթերմային կայունությունը:
